Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RIPK4P57078 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RIPK4P57078 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RIPK4P57078 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RIPK4P57078 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RIPK4P57078 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms