Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RWDD2BP57060 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RWDD2BP57060 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms