Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX10P56693 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX10P56693 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SOX10P56693 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX10P56693 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX10P56693 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX10P56693 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX10P56693 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX10P56693 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SOX10P56693 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX10P56693 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX10P56693 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX10P56693 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SOX10P56693 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX10P56693 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX10P56693 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX10P56693 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX10P56693 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX10P56693 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX10P56693 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SOX10P56693 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX10P56693 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOX10P56693 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SOX10P56693 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SOX10P56693 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX10P56693 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX10P56693 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX10P56693 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX10P56693 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX10P56693 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX10P56693 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SOX10P56693 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOX10P56693 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX10P56693 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SOX10P56693 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX10P56693 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX10P56693 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX10P56693 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX10P56693 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX10P56693 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SOX10P56693 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX10P56693 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX10P56693 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX10P56693 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX10P56693 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX10P56693 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SOX10P56693 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX10P56693 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX10P56693 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX10P56693 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SOX10P56693 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX10P56693 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX10P56693 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX10P56693 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX10P56693 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SOX10P56693 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX10P56693 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX10P56693 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX10P56693 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SOX10P56693 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOX10P56693 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOX10P56693 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX10P56693 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX10P56693 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX10P56693 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX10P56693 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX10P56693 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX10P56693 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX10P56693 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOX10P56693 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX10P56693 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX10P56693 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX10P56693 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX10P56693 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOX10P56693 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX10P56693 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX10P56693 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX10P56693 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms