Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPP55072 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPP55072 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPP55072 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPP55072 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPP55072 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPP55072 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPP55072 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPP55072 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCPP55072 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPP55072 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPP55072 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPP55072 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCPP55072 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPP55072 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPP55072 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPP55072 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPP55072 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPP55072 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPP55072 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCPP55072 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPP55072 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPP55072 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPP55072 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPP55072 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VCPP55072 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPP55072 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPP55072 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPP55072 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCPP55072 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPP55072 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPP55072 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPP55072 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPP55072 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPP55072 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPP55072 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCPP55072 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCPP55072 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCPP55072 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPP55072 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPP55072 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPP55072 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPP55072 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPP55072 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPP55072 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPP55072 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPP55072 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPP55072 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPP55072 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPP55072 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPP55072 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPP55072 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPP55072 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPP55072 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPP55072 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPP55072 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPP55072 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPP55072 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPP55072 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPP55072 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPP55072 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPP55072 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPP55072 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPP55072 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPP55072 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPP55072 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPP55072 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPP55072 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPP55072 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPP55072 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPP55072 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPP55072 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCPP55072 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCPP55072 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPP55072 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCPP55072 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCPP55072 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCPP55072 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCPP55072 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCPP55072 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCPP55072 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCPP55072 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCPP55072 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCPP55072 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPP55072 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms