Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RARRES1P49788 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RARRES1P49788 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RARRES1P49788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RARRES1P49788 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RARRES1P49788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RARRES1P49788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARRES1P49788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARRES1P49788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARRES1P49788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARRES1P49788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RARRES1P49788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RARRES1P49788 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RARRES1P49788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARRES1P49788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARRES1P49788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARRES1P49788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARRES1P49788 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RARRES1P49788 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RARRES1P49788 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARRES1P49788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RARRES1P49788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARRES1P49788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARRES1P49788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARRES1P49788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms