Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRA4P48169 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA4P48169 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA4P48169 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA4P48169 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms