Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ID4P47928 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ID4P47928 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ID4P47928 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ID4P47928 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ID4P47928 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ID4P47928 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ID4P47928 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ID4P47928 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ID4P47928 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ID4P47928 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ID4P47928 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ID4P47928 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ID4P47928 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ID4P47928 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ID4P47928 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ID4P47928 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ID4P47928 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ID4P47928 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ID4P47928 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ID4P47928 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ID4P47928 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ID4P47928 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ID4P47928 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ID4P47928 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ID4P47928 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ID4P47928 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ID4P47928 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ID4P47928 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ID4P47928 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ID4P47928 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ID4P47928 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ID4P47928 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ID4P47928 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ID4P47928 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ID4P47928 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ID4P47928 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ID4P47928 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ID4P47928 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ID4P47928 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ID4P47928 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ID4P47928 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ID4P47928 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ID4P47928 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ID4P47928 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ID4P47928 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ID4P47928 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ID4P47928 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ID4P47928 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ID4P47928 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ID4P47928 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ID4P47928 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ID4P47928 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ID4P47928 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ID4P47928 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ID4P47928 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ID4P47928 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ID4P47928 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ID4P47928 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ID4P47928 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ID4P47928 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ID4P47928 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ID4P47928 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ID4P47928 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ID4P47928 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ID4P47928 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ID4P47928 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ID4P47928 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ID4P47928 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ID4P47928 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ID4P47928 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ID4P47928 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ID4P47928 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ID4P47928 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ID4P47928 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ID4P47928 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ID4P47928 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ID4P47928 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ID4P47928 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ID4P47928 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ID4P47928 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ID4P47928 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ID4P47928 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ID4P47928 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms