Protein–RNA interactions for Protein: P47023

TY4A-J, Transposon Ty4-J Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4A-JP47023 OCA1YNL099C 717 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 DRS1YLL008W 2259 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 PEX28YHR150W 1740 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 ICE2YIL090W 1476 nt7.36□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 SEM1YDR363W-A 270 nt7.36□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 COA2YPL189C-A 207 nt7.36□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 YBL111CYBL111C 2004 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 SEC24YIL109C 2781 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 TOD6YBL054W 1578 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 CPR2YHR057C 618 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 NCA3YJL116C 1014 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 AVL9YLR114C 2295 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 ICL2YPR006C 1728 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 ATG7YHR171W 1893 nt7.34□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 YGL072CYGL072C 360 nt7.34□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 AVO2YMR068W 1281 nt7.34□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 RPR1RPR1 369 nt7.34□□□□□ -1.23
TY4A-JP47023 BNA5YLR231C 1362 nt7.33□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 COS6YGR295C 1146 nt7.33□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 PIH1YHR034C 1035 nt7.33□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 YLR358CYLR358C 564 nt7.33□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 YPR150WYPR150W 522 nt7.33□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 SOH1YGL127C 384 nt7.32□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 TAF11YML015C 1041 nt7.32□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 TRP5YGL026C 2124 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 SIT1YEL065W 1887 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 PIC2YER053C 903 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 TES1YJR019C 1050 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 YNR068CYNR068C 819 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 DDC1YPL194W 1839 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 ERG12YMR208W 1332 nt7.3□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.3□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.3□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 NUP57YGR119C 1626 nt7.3□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 STE3YKL178C 1413 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 YGL118CYGL118C 438 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 GTS1YGL181W 1191 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 CDA1YLR307W 906 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 SDH8YBR269C 417 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 VMS1YDR049W 1899 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 VPS72YDR485C 2388 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 TPO1YLL028W 1761 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 CDC23YHR166C 1881 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 ARP10YDR106W 855 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 PUP2YGR253C 783 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 REV7YIL139C 738 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 SEC18YBR080C 2277 nt7.27□□□□□ -1.24
TY4A-JP47023 GAT1YFL021W 1533 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 CDC10YCR002C 969 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 RRP43YCR035C 1185 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 MMS21YEL019C 804 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 DST1YGL043W 930 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 SNP1YIL061C 903 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 NAT5YOR253W 531 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 RFS1YBR052C 633 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 ERV2YPR037C 591 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 IES1YFL013C 2079 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 PPS1YBR276C 2424 nt7.26□□□□□ -1.25
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TY4A-JP47023 GET2YER083C 858 nt7.26□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 ERP5YHR110W 639 nt7.26□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 YNL295WYNL295W 1575 nt7.25□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 DOC1YGL240W 753 nt7.25□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 ELP6YMR312W 822 nt7.25□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 ATP23YNR020C 813 nt7.25□□□□□ -1.25
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TY4A-JP47023 NMA2YGR010W 1188 nt7.24□□□□□ -1.25
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TY4A-JP47023 YBL113CYBL113C 2379 nt7.23□□□□□ -1.25
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TY4A-JP47023 ARO10YDR380W 1908 nt7.23□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 DCR2YLR361C 1737 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 DUG1YFR044C 1446 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 SNF7YLR025W 723 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 ASR1YPR093C 867 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 YIL092WYIL092W 1902 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 PGI1YBR196C 1665 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 UME1YPL139C 1383 nt7.21□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 BRN1YBL097W 2265 nt7.21□□□□□ -1.25
TY4A-JP47023 SNA3YJL151C 402 nt7.21□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 JJJ3YJR097W 519 nt7.21□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 RCF2YNR018W 675 nt7.21□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 MSI1YBR195C 1269 nt7.21□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 TRP1YDR007W 675 nt7.2□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 SKG1YKR100C 1068 nt7.2□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 FLC2YAL053W 2352 nt7.2□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 TCB1YOR086C 3561 nt7.2□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 MSS116YDR194C 1995 nt7.19□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 AIM41YOR215C 558 nt7.19□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 MNN9YPL050C 1188 nt7.19□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 HRB1YNL004W 1365 nt7.19□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 CDS1YBR029C 1374 nt7.19□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 MTC6YHR151C 1581 nt7.18□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 YNR048WYNR048W 1182 nt7.18□□□□□ -1.26
TY4A-JP47023 LEO1YOR123C 1395 nt7.18□□□□□ -1.26
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