Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNT3P45378 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNT3P45378 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNT3P45378 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms