Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BMI1P35226 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMI1P35226 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMI1P35226 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMI1P35226 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMI1P35226 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMI1P35226 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMI1P35226 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BMI1P35226 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMI1P35226 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMI1P35226 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BMI1P35226 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMI1P35226 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMI1P35226 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMI1P35226 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BMI1P35226 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMI1P35226 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMI1P35226 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMI1P35226 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMI1P35226 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BMI1P35226 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMI1P35226 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMI1P35226 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMI1P35226 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMI1P35226 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BMI1P35226 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BMI1P35226 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BMI1P35226 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMI1P35226 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMI1P35226 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMI1P35226 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMI1P35226 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BMI1P35226 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMI1P35226 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMI1P35226 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BMI1P35226 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMI1P35226 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMI1P35226 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMI1P35226 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BMI1P35226 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BMI1P35226 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BMI1P35226 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BMI1P35226 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BMI1P35226 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BMI1P35226 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BMI1P35226 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BMI1P35226 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BMI1P35226 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BMI1P35226 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BMI1P35226 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BMI1P35226 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMI1P35226 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMI1P35226 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMI1P35226 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMI1P35226 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMI1P35226 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMI1P35226 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMI1P35226 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms