Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHC1P29353 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHC1P29353 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHC1P29353 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHC1P29353 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHC1P29353 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHC1P29353 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHC1P29353 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHC1P29353 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHC1P29353 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHC1P29353 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC1P29353 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC1P29353 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHC1P29353 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHC1P29353 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC1P29353 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC1P29353 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC1P29353 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC1P29353 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC1P29353 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC1P29353 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHC1P29353 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC1P29353 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC1P29353 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC1P29353 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC1P29353 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC1P29353 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC1P29353 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC1P29353 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC1P29353 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC1P29353 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHC1P29353 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHC1P29353 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHC1P29353 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHC1P29353 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms