Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NMBRP28336 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMBRP28336 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NMBRP28336 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NMBRP28336 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMBRP28336 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMBRP28336 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMBRP28336 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMBRP28336 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMBRP28336 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NMBRP28336 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMBRP28336 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NMBRP28336 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NMBRP28336 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NMBRP28336 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NMBRP28336 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NMBRP28336 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMBRP28336 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMBRP28336 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMBRP28336 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMBRP28336 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMBRP28336 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NMBRP28336 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMBRP28336 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMBRP28336 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMBRP28336 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMBRP28336 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMBRP28336 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMBRP28336 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMBRP28336 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMBRP28336 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NMBRP28336 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NMBRP28336 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NMBRP28336 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NMBRP28336 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NMBRP28336 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMBRP28336 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMBRP28336 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMBRP28336 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMBRP28336 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NMBRP28336 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NMBRP28336 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMBRP28336 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMBRP28336 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMBRP28336 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMBRP28336 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMBRP28336 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMBRP28336 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NMBRP28336 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NMBRP28336 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NMBRP28336 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NMBRP28336 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMBRP28336 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMBRP28336 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NMBRP28336 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMBRP28336 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NMBRP28336 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NMBRP28336 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NMBRP28336 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NMBRP28336 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NMBRP28336 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NMBRP28336 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NMBRP28336 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NMBRP28336 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NMBRP28336 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NMBRP28336 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NMBRP28336 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NMBRP28336 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NMBRP28336 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NMBRP28336 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMBRP28336 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMBRP28336 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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