Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK3P27448 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK3P27448 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK3P27448 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK3P27448 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK3P27448 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK3P27448 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK3P27448 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK3P27448 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MARK3P27448 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARK3P27448 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARK3P27448 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MARK3P27448 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARK3P27448 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK3P27448 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK3P27448 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK3P27448 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK3P27448 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK3P27448 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK3P27448 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK3P27448 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK3P27448 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK3P27448 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK3P27448 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK3P27448 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK3P27448 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK3P27448 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK3P27448 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARK3P27448 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARK3P27448 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARK3P27448 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARK3P27448 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARK3P27448 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARK3P27448 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MARK3P27448 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARK3P27448 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARK3P27448 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARK3P27448 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MARK3P27448 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK3P27448 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK3P27448 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK3P27448 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK3P27448 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK3P27448 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARK3P27448 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARK3P27448 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARK3P27448 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARK3P27448 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MARK3P27448 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARK3P27448 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARK3P27448 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARK3P27448 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARK3P27448 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARK3P27448 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARK3P27448 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MARK3P27448 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARK3P27448 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARK3P27448 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARK3P27448 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARK3P27448 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK3P27448 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK3P27448 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK3P27448 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK3P27448 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK3P27448 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK3P27448 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK3P27448 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARK3P27448 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARK3P27448 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARK3P27448 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARK3P27448 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARK3P27448 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARK3P27448 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARK3P27448 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARK3P27448 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARK3P27448 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MARK3P27448 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MARK3P27448 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MARK3P27448 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARK3P27448 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARK3P27448 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARK3P27448 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARK3P27448 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MARK3P27448 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MARK3P27448 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MARK3P27448 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms