Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTFP26441 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTFP26441 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTFP26441 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTFP26441 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTFP26441 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTFP26441 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTFP26441 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTFP26441 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTFP26441 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTFP26441 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTFP26441 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTFP26441 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTFP26441 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTFP26441 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTFP26441 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTFP26441 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTFP26441 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTFP26441 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTFP26441 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTFP26441 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTFP26441 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTFP26441 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTFP26441 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTFP26441 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTFP26441 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTFP26441 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTFP26441 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTFP26441 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTFP26441 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTFP26441 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTFP26441 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTFP26441 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTFP26441 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTFP26441 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTFP26441 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTFP26441 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTFP26441 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTFP26441 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTFP26441 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTFP26441 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTFP26441 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTFP26441 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTFP26441 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTFP26441 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTFP26441 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTFP26441 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTFP26441 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTFP26441 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTFP26441 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTFP26441 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTFP26441 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTFP26441 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTFP26441 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTFP26441 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTFP26441 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTFP26441 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTFP26441 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTFP26441 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTFP26441 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTFP26441 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTFP26441 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTFP26441 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTFP26441 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTFP26441 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTFP26441 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTFP26441 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTFP26441 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTFP26441 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms