Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMA4P25789 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA4P25789 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms