Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACBP22694 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACBP22694 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKACBP22694 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms