Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PVALBP20472 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PVALBP20472 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PVALBP20472 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PVALBP20472 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PVALBP20472 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PVALBP20472 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PVALBP20472 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PVALBP20472 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PVALBP20472 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PVALBP20472 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PVALBP20472 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PVALBP20472 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PVALBP20472 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PVALBP20472 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PVALBP20472 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PVALBP20472 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PVALBP20472 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PVALBP20472 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PVALBP20472 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PVALBP20472 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PVALBP20472 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PVALBP20472 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PVALBP20472 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PVALBP20472 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PVALBP20472 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PVALBP20472 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PVALBP20472 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PVALBP20472 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PVALBP20472 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PVALBP20472 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PVALBP20472 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PVALBP20472 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PVALBP20472 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PVALBP20472 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PVALBP20472 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PVALBP20472 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PVALBP20472 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PVALBP20472 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PVALBP20472 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PVALBP20472 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PVALBP20472 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PVALBP20472 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PVALBP20472 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PVALBP20472 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PVALBP20472 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PVALBP20472 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PVALBP20472 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PVALBP20472 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PVALBP20472 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PVALBP20472 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PVALBP20472 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PVALBP20472 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PVALBP20472 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PVALBP20472 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PVALBP20472 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PVALBP20472 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PVALBP20472 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PVALBP20472 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PVALBP20472 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PVALBP20472 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms