Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A1P19634 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC9A1P19634 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC9A1P19634 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9A1P19634 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC9A1P19634 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms