Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFE3P19532 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFE3P19532 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFE3P19532 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFE3P19532 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFE3P19532 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFE3P19532 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFE3P19532 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFE3P19532 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFE3P19532 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFE3P19532 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFE3P19532 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFE3P19532 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFE3P19532 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFE3P19532 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFE3P19532 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFE3P19532 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFE3P19532 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFE3P19532 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFE3P19532 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFE3P19532 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFE3P19532 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFE3P19532 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFE3P19532 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFE3P19532 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFE3P19532 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFE3P19532 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFE3P19532 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFE3P19532 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFE3P19532 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFE3P19532 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFE3P19532 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFE3P19532 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFE3P19532 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFE3P19532 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFE3P19532 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFE3P19532 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFE3P19532 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFE3P19532 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFE3P19532 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFE3P19532 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFE3P19532 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TFE3P19532 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFE3P19532 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFE3P19532 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFE3P19532 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFE3P19532 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFE3P19532 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TFE3P19532 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFE3P19532 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFE3P19532 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFE3P19532 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFE3P19532 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFE3P19532 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFE3P19532 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFE3P19532 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFE3P19532 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFE3P19532 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFE3P19532 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFE3P19532 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFE3P19532 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFE3P19532 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFE3P19532 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFE3P19532 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFE3P19532 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFE3P19532 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TFE3P19532 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFE3P19532 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TFE3P19532 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFE3P19532 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFE3P19532 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFE3P19532 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFE3P19532 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFE3P19532 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFE3P19532 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms