Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPI1P17947 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPI1P17947 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPI1P17947 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPI1P17947 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPI1P17947 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPI1P17947 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPI1P17947 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPI1P17947 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPI1P17947 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPI1P17947 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPI1P17947 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPI1P17947 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPI1P17947 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPI1P17947 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPI1P17947 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPI1P17947 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPI1P17947 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPI1P17947 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPI1P17947 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPI1P17947 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPI1P17947 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPI1P17947 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPI1P17947 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPI1P17947 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPI1P17947 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPI1P17947 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPI1P17947 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPI1P17947 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPI1P17947 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPI1P17947 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPI1P17947 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPI1P17947 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPI1P17947 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPI1P17947 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPI1P17947 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPI1P17947 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPI1P17947 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPI1P17947 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPI1P17947 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPI1P17947 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPI1P17947 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPI1P17947 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPI1P17947 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPI1P17947 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPI1P17947 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPI1P17947 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPI1P17947 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPI1P17947 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPI1P17947 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPI1P17947 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPI1P17947 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPI1P17947 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPI1P17947 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms