Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2P17301 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2P17301 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms