Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CSF2RAP15509 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSF2RAP15509 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSF2RAP15509 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSF2RAP15509 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF2RAP15509 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF2RAP15509 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF2RAP15509 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CSF2RAP15509 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms