Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYL4P12829 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYL4P12829 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYL4P12829 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYL4P12829 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYL4P12829 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYL4P12829 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYL4P12829 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL4P12829 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL4P12829 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL4P12829 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL4P12829 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL4P12829 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL4P12829 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYL4P12829 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL4P12829 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL4P12829 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL4P12829 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL4P12829 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL4P12829 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYL4P12829 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL4P12829 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL4P12829 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL4P12829 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL4P12829 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MYL4P12829 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL4P12829 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYL4P12829 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL4P12829 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL4P12829 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MYL4P12829 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL4P12829 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL4P12829 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL4P12829 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL4P12829 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYL4P12829 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL4P12829 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL4P12829 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL4P12829 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL4P12829 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL4P12829 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL4P12829 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYL4P12829 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL4P12829 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYL4P12829 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL4P12829 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL4P12829 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL4P12829 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYL4P12829 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MYL4P12829 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL4P12829 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL4P12829 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL4P12829 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL4P12829 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL4P12829 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYL4P12829 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL4P12829 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL4P12829 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL4P12829 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MYL4P12829 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL4P12829 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL4P12829 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL4P12829 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYL4P12829 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYL4P12829 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL4P12829 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL4P12829 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MYL4P12829 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYL4P12829 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYL4P12829 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYL4P12829 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYL4P12829 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYL4P12829 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL4P12829 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL4P12829 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL4P12829 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYL4P12829 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYL4P12829 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYL4P12829 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYL4P12829 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYL4P12829 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYL4P12829 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYL4P12829 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL4P12829 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL4P12829 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL4P12829 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL4P12829 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYL4P12829 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYL4P12829 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms