Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNB1P11230 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNB1P11230 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNB1P11230 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB1P11230 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms