Protein–RNA interactions for Protein: P10253

GAA, Lysosomal alpha-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAAP10253 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAAP10253 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAAP10253 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAAP10253 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAAP10253 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAAP10253 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAAP10253 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAAP10253 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAAP10253 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAAP10253 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAAP10253 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAAP10253 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAAP10253 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAAP10253 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAAP10253 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAAP10253 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAAP10253 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAAP10253 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAAP10253 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAAP10253 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAAP10253 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAAP10253 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAAP10253 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAAP10253 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAAP10253 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAAP10253 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAAP10253 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAAP10253 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAAP10253 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAAP10253 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAAP10253 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAAP10253 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAAP10253 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAAP10253 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAAP10253 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAAP10253 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAAP10253 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAAP10253 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAAP10253 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAAP10253 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAAP10253 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAAP10253 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAAP10253 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAAP10253 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAAP10253 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAAP10253 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAAP10253 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAAP10253 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAAP10253 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GAAP10253 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAAP10253 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAAP10253 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAAP10253 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAAP10253 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAAP10253 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAAP10253 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAAP10253 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GAAP10253 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAAP10253 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAAP10253 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAAP10253 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAAP10253 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms