Protein–RNA interactions for Protein: P10253

GAA, Lysosomal alpha-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAAP10253 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GAAP10253 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GAAP10253 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAAP10253 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAAP10253 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GAAP10253 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAAP10253 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAAP10253 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GAAP10253 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GAAP10253 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GAAP10253 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GAAP10253 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GAAP10253 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GAAP10253 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GAAP10253 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GAAP10253 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAAP10253 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GAAP10253 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GAAP10253 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GAAP10253 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GAAP10253 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GAAP10253 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GAAP10253 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAAP10253 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAAP10253 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GAAP10253 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GAAP10253 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GAAP10253 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GAAP10253 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GAAP10253 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAAP10253 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAAP10253 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAAP10253 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAAP10253 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAAP10253 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAAP10253 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAAP10253 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GAAP10253 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GAAP10253 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAAP10253 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAAP10253 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GAAP10253 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAAP10253 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAAP10253 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GAAP10253 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GAAP10253 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GAAP10253 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GAAP10253 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GAAP10253 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GAAP10253 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GAAP10253 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GAAP10253 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GAAP10253 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GAAP10253 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GAAP10253 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GAAP10253 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GAAP10253 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAAP10253 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GAAP10253 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GAAP10253 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAAP10253 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAAP10253 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAAP10253 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAAP10253 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAAP10253 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAAP10253 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GAAP10253 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GAAP10253 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GAAP10253 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GAAP10253 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GAAP10253 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAAP10253 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAAP10253 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAAP10253 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAAP10253 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAAP10253 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GAAP10253 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GAAP10253 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GAAP10253 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GAAP10253 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GAAP10253 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAAP10253 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GAAP10253 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GAAP10253 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GAAP10253 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAAP10253 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAAP10253 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAAP10253 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAAP10253 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GAAP10253 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAAP10253 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAAP10253 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GAAP10253 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GAAP10253 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAAP10253 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAAP10253 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAAP10253 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAAP10253 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAAP10253 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GAAP10253 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms