Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VSIG8P0DPA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VSIG8P0DPA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
VSIG8P0DPA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VSIG8P0DPA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VSIG8P0DPA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms