Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPP08247 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPP08247 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPP08247 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPP08247 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPP08247 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPP08247 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPP08247 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPP08247 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPP08247 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPP08247 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPP08247 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYPP08247 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYPP08247 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYPP08247 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYPP08247 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPP08247 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPP08247 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPP08247 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPP08247 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPP08247 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPP08247 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPP08247 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPP08247 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPP08247 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPP08247 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPP08247 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPP08247 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPP08247 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPP08247 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPP08247 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPP08247 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPP08247 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPP08247 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPP08247 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPP08247 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPP08247 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPP08247 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPP08247 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPP08247 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPP08247 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPP08247 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPP08247 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPP08247 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPP08247 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPP08247 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPP08247 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPP08247 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPP08247 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPP08247 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPP08247 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPP08247 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYPP08247 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYPP08247 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYPP08247 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYPP08247 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYPP08247 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYPP08247 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPP08247 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYPP08247 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYPP08247 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYPP08247 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYPP08247 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYPP08247 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYPP08247 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPP08247 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPP08247 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPP08247 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYPP08247 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPP08247 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPP08247 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYPP08247 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPP08247 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPP08247 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPP08247 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPP08247 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPP08247 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPP08247 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYPP08247 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPP08247 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPP08247 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPP08247 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPP08247 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPP08247 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYPP08247 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms