Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NGFRP08138 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NGFRP08138 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NGFRP08138 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NGFRP08138 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NGFRP08138 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NGFRP08138 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NGFRP08138 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NGFRP08138 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NGFRP08138 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NGFRP08138 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NGFRP08138 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NGFRP08138 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NGFRP08138 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NGFRP08138 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NGFRP08138 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NGFRP08138 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NGFRP08138 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NGFRP08138 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NGFRP08138 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NGFRP08138 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NGFRP08138 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NGFRP08138 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NGFRP08138 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NGFRP08138 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NGFRP08138 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NGFRP08138 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NGFRP08138 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NGFRP08138 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NGFRP08138 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NGFRP08138 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NGFRP08138 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NGFRP08138 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NGFRP08138 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NGFRP08138 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NGFRP08138 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NGFRP08138 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NGFRP08138 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NGFRP08138 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NGFRP08138 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NGFRP08138 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NGFRP08138 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NGFRP08138 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NGFRP08138 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NGFRP08138 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NGFRP08138 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NGFRP08138 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NGFRP08138 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NGFRP08138 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGFRP08138 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGFRP08138 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGFRP08138 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGFRP08138 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGFRP08138 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NGFRP08138 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGFRP08138 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGFRP08138 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGFRP08138 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGFRP08138 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NGFRP08138 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGFRP08138 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGFRP08138 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGFRP08138 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGFRP08138 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NGFRP08138 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NGFRP08138 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGFRP08138 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGFRP08138 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NGFRP08138 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGFRP08138 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NGFRP08138 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGFRP08138 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGFRP08138 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NGFRP08138 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGFRP08138 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NGFRP08138 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NGFRP08138 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms