Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA4P06727 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOA4P06727 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA4P06727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA4P06727 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA4P06727 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA4P06727 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA4P06727 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA4P06727 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA4P06727 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA4P06727 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA4P06727 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOA4P06727 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA4P06727 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA4P06727 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA4P06727 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA4P06727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA4P06727 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA4P06727 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA4P06727 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA4P06727 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA4P06727 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA4P06727 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA4P06727 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA4P06727 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA4P06727 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA4P06727 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA4P06727 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA4P06727 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA4P06727 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA4P06727 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA4P06727 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA4P06727 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA4P06727 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOA4P06727 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOA4P06727 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA4P06727 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA4P06727 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA4P06727 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA4P06727 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA4P06727 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA4P06727 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA4P06727 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA4P06727 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA4P06727 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA4P06727 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA4P06727 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA4P06727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA4P06727 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA4P06727 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA4P06727 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA4P06727 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA4P06727 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA4P06727 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA4P06727 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA4P06727 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA4P06727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA4P06727 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA4P06727 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA4P06727 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA4P06727 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA4P06727 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA4P06727 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA4P06727 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA4P06727 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA4P06727 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA4P06727 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA4P06727 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA4P06727 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA4P06727 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA4P06727 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA4P06727 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA4P06727 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA4P06727 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA4P06727 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA4P06727 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA4P06727 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA4P06727 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA4P06727 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA4P06727 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA4P06727 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA4P06727 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA4P06727 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA4P06727 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms