Protein–RNA interactions for Protein: P05231

IL6, Interleukin-6, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6P05231 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL6P05231 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL6P05231 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL6P05231 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL6P05231 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL6P05231 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IL6P05231 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IL6P05231 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IL6P05231 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IL6P05231 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL6P05231 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL6P05231 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IL6P05231 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL6P05231 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IL6P05231 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL6P05231 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IL6P05231 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IL6P05231 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL6P05231 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL6P05231 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL6P05231 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL6P05231 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IL6P05231 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IL6P05231 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL6P05231 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL6P05231 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL6P05231 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL6P05231 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IL6P05231 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IL6P05231 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IL6P05231 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IL6P05231 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL6P05231 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL6P05231 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL6P05231 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IL6P05231 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL6P05231 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL6P05231 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL6P05231 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL6P05231 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IL6P05231 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IL6P05231 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL6P05231 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL6P05231 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL6P05231 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL6P05231 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL6P05231 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL6P05231 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IL6P05231 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL6P05231 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL6P05231 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL6P05231 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL6P05231 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL6P05231 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IL6P05231 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IL6P05231 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IL6P05231 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IL6P05231 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IL6P05231 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL6P05231 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL6P05231 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IL6P05231 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms