Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB6O95452 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB6O95452 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB6O95452 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB6O95452 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB6O95452 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB6O95452 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB6O95452 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB6O95452 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB6O95452 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB6O95452 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB6O95452 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB6O95452 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB6O95452 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB6O95452 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB6O95452 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB6O95452 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB6O95452 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB6O95452 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB6O95452 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB6O95452 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB6O95452 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB6O95452 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB6O95452 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB6O95452 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB6O95452 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB6O95452 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB6O95452 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB6O95452 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB6O95452 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB6O95452 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB6O95452 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB6O95452 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB6O95452 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB6O95452 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB6O95452 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB6O95452 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB6O95452 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB6O95452 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB6O95452 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB6O95452 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB6O95452 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB6O95452 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB6O95452 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB6O95452 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB6O95452 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB6O95452 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB6O95452 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB6O95452 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB6O95452 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB6O95452 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB6O95452 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB6O95452 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB6O95452 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB6O95452 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB6O95452 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB6O95452 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB6O95452 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB6O95452 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB6O95452 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB6O95452 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB6O95452 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB6O95452 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB6O95452 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB6O95452 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB6O95452 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB6O95452 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB6O95452 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB6O95452 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB6O95452 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms