Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1O95273 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1O95273 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNDBP1O95273 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNDBP1O95273 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms