Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRATO95237 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRATO95237 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRATO95237 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRATO95237 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRATO95237 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRATO95237 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRATO95237 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRATO95237 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRATO95237 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRATO95237 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRATO95237 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRATO95237 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRATO95237 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRATO95237 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRATO95237 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRATO95237 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRATO95237 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRATO95237 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRATO95237 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRATO95237 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRATO95237 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRATO95237 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRATO95237 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRATO95237 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRATO95237 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRATO95237 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRATO95237 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRATO95237 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRATO95237 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRATO95237 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRATO95237 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRATO95237 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRATO95237 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRATO95237 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRATO95237 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRATO95237 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRATO95237 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRATO95237 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRATO95237 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRATO95237 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRATO95237 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRATO95237 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRATO95237 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRATO95237 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRATO95237 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRATO95237 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRATO95237 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRATO95237 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRATO95237 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRATO95237 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRATO95237 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRATO95237 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRATO95237 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRATO95237 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRATO95237 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRATO95237 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRATO95237 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRATO95237 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRATO95237 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRATO95237 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRATO95237 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRATO95237 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRATO95237 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRATO95237 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRATO95237 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRATO95237 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRATO95237 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRATO95237 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRATO95237 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms