Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBL3O95164 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL3O95164 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL3O95164 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL3O95164 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL3O95164 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL3O95164 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL3O95164 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL3O95164 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL3O95164 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL3O95164 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL3O95164 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL3O95164 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL3O95164 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL3O95164 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL3O95164 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL3O95164 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL3O95164 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL3O95164 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL3O95164 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL3O95164 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL3O95164 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL3O95164 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL3O95164 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL3O95164 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBL3O95164 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL3O95164 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL3O95164 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL3O95164 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL3O95164 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBL3O95164 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBL3O95164 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBL3O95164 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBL3O95164 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL3O95164 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL3O95164 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL3O95164 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL3O95164 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL3O95164 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL3O95164 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL3O95164 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL3O95164 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL3O95164 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL3O95164 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL3O95164 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL3O95164 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL3O95164 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL3O95164 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL3O95164 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL3O95164 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL3O95164 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL3O95164 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL3O95164 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL3O95164 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL3O95164 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL3O95164 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL3O95164 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL3O95164 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL3O95164 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL3O95164 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL3O95164 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL3O95164 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL3O95164 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL3O95164 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL3O95164 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL3O95164 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL3O95164 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL3O95164 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL3O95164 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms