Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX3O95076 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX3O95076 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX3O95076 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX3O95076 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALX3O95076 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX3O95076 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX3O95076 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX3O95076 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX3O95076 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX3O95076 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX3O95076 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX3O95076 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX3O95076 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX3O95076 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX3O95076 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX3O95076 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX3O95076 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX3O95076 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX3O95076 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX3O95076 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX3O95076 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX3O95076 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX3O95076 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX3O95076 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX3O95076 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX3O95076 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX3O95076 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX3O95076 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX3O95076 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX3O95076 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX3O95076 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX3O95076 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX3O95076 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX3O95076 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX3O95076 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX3O95076 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX3O95076 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX3O95076 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX3O95076 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX3O95076 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX3O95076 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX3O95076 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX3O95076 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX3O95076 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX3O95076 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX3O95076 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX3O95076 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX3O95076 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX3O95076 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX3O95076 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX3O95076 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX3O95076 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX3O95076 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX3O95076 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX3O95076 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX3O95076 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX3O95076 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX3O95076 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX3O95076 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX3O95076 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX3O95076 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX3O95076 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX3O95076 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX3O95076 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALX3O95076 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALX3O95076 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX3O95076 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALX3O95076 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALX3O95076 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX3O95076 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms