Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCC1O94876 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCC1O94876 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCC1O94876 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCC1O94876 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms