Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP3O75386 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP3O75386 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP3O75386 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP3O75386 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TULP3O75386 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP3O75386 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP3O75386 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP3O75386 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TULP3O75386 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP3O75386 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TULP3O75386 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TULP3O75386 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP3O75386 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TULP3O75386 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP3O75386 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP3O75386 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP3O75386 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP3O75386 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP3O75386 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP3O75386 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TULP3O75386 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP3O75386 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP3O75386 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP3O75386 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP3O75386 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TULP3O75386 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP3O75386 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP3O75386 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP3O75386 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP3O75386 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP3O75386 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TULP3O75386 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP3O75386 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP3O75386 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP3O75386 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP3O75386 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP3O75386 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP3O75386 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TULP3O75386 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP3O75386 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP3O75386 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TULP3O75386 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP3O75386 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP3O75386 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TULP3O75386 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP3O75386 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP3O75386 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TULP3O75386 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP3O75386 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TULP3O75386 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TULP3O75386 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP3O75386 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TULP3O75386 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP3O75386 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP3O75386 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TULP3O75386 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP3O75386 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP3O75386 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP3O75386 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP3O75386 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP3O75386 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TULP3O75386 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP3O75386 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP3O75386 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TULP3O75386 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP3O75386 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP3O75386 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP3O75386 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP3O75386 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP3O75386 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP3O75386 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP3O75386 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TULP3O75386 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP3O75386 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP3O75386 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP3O75386 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TULP3O75386 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TULP3O75386 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP3O75386 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms