Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SORBS3O60504 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SORBS3O60504 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SORBS3O60504 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SORBS3O60504 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms