Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXTL3O43909 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXTL3O43909 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms