Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERI3O43414 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERI3O43414 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERI3O43414 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERI3O43414 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERI3O43414 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERI3O43414 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERI3O43414 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERI3O43414 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERI3O43414 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERI3O43414 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERI3O43414 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERI3O43414 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERI3O43414 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERI3O43414 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERI3O43414 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERI3O43414 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERI3O43414 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERI3O43414 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERI3O43414 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERI3O43414 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERI3O43414 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI3O43414 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI3O43414 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI3O43414 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI3O43414 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI3O43414 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI3O43414 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERI3O43414 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI3O43414 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI3O43414 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI3O43414 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI3O43414 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI3O43414 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI3O43414 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERI3O43414 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI3O43414 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI3O43414 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI3O43414 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERI3O43414 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERI3O43414 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERI3O43414 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERI3O43414 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERI3O43414 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERI3O43414 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERI3O43414 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERI3O43414 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERI3O43414 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERI3O43414 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERI3O43414 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI3O43414 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI3O43414 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI3O43414 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI3O43414 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI3O43414 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI3O43414 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERI3O43414 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI3O43414 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI3O43414 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI3O43414 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERI3O43414 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI3O43414 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI3O43414 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI3O43414 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERI3O43414 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI3O43414 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI3O43414 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI3O43414 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI3O43414 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI3O43414 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERI3O43414 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI3O43414 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI3O43414 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERI3O43414 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI3O43414 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI3O43414 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI3O43414 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI3O43414 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI3O43414 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERI3O43414 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI3O43414 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI3O43414 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI3O43414 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI3O43414 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI3O43414 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI3O43414 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERI3O43414 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERI3O43414 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERI3O43414 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERI3O43414 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms