Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SART1O43290 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SART1O43290 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SART1O43290 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SART1O43290 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SART1O43290 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SART1O43290 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SART1O43290 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SART1O43290 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SART1O43290 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SART1O43290 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SART1O43290 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SART1O43290 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SART1O43290 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SART1O43290 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SART1O43290 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SART1O43290 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SART1O43290 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SART1O43290 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SART1O43290 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SART1O43290 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SART1O43290 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SART1O43290 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SART1O43290 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SART1O43290 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SART1O43290 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SART1O43290 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SART1O43290 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SART1O43290 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SART1O43290 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SART1O43290 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SART1O43290 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SART1O43290 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SART1O43290 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SART1O43290 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SART1O43290 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SART1O43290 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SART1O43290 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SART1O43290 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SART1O43290 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SART1O43290 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SART1O43290 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SART1O43290 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SART1O43290 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SART1O43290 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SART1O43290 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SART1O43290 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SART1O43290 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SART1O43290 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SART1O43290 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SART1O43290 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SART1O43290 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SART1O43290 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SART1O43290 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SART1O43290 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SART1O43290 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SART1O43290 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SART1O43290 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SART1O43290 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SART1O43290 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SART1O43290 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SART1O43290 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SART1O43290 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SART1O43290 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SART1O43290 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SART1O43290 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SART1O43290 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SART1O43290 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SART1O43290 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SART1O43290 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SART1O43290 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SART1O43290 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SART1O43290 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SART1O43290 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SART1O43290 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SART1O43290 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms