Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP73O15350 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP73O15350 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP73O15350 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP73O15350 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP73O15350 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP73O15350 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP73O15350 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP73O15350 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP73O15350 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP73O15350 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP73O15350 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TP73O15350 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP73O15350 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP73O15350 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP73O15350 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP73O15350 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TP73O15350 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP73O15350 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP73O15350 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP73O15350 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP73O15350 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP73O15350 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP73O15350 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP73O15350 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP73O15350 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP73O15350 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP73O15350 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP73O15350 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP73O15350 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP73O15350 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP73O15350 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP73O15350 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP73O15350 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP73O15350 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP73O15350 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP73O15350 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP73O15350 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TP73O15350 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP73O15350 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP73O15350 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP73O15350 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP73O15350 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP73O15350 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP73O15350 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TP73O15350 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP73O15350 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TP73O15350 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TP73O15350 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP73O15350 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP73O15350 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP73O15350 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP73O15350 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP73O15350 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TP73O15350 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TP73O15350 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TP73O15350 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TP73O15350 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TP73O15350 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TP73O15350 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TP73O15350 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP73O15350 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP73O15350 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP73O15350 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TP73O15350 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP73O15350 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TP73O15350 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP73O15350 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP73O15350 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TP73O15350 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TP73O15350 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP73O15350 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP73O15350 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TP73O15350 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms