Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PFDN6O15212 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFDN6O15212 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms