Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3EO15041 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3EO15041 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3EO15041 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3EO15041 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEMA3EO15041 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SEMA3EO15041 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEMA3EO15041 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEMA3EO15041 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms