Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2O14595 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2O14595 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2O14595 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2O14595 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2O14595 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSP2O14595 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2O14595 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2O14595 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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