Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGRMC1O00264 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGRMC1O00264 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGRMC1O00264 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGRMC1O00264 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGRMC1O00264 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGRMC1O00264 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGRMC1O00264 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGRMC1O00264 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGRMC1O00264 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGRMC1O00264 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGRMC1O00264 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms