Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
J3KR12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
J3KR12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
J3KR12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
J3KR12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
J3KR12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
J3KR12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
J3KR12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
J3KR12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
J3KR12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3KR12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3KR12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
J3KR12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3KR12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3KR12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3KR12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
J3KR12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
J3KR12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
J3KR12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
J3KR12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3KR12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3KR12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3KR12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3KR12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3KR12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3KR12 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3KR12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
J3KR12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
J3KR12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
J3KR12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
J3KR12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
J3KR12 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
J3KR12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
J3KR12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
J3KR12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
J3KR12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
J3KR12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
J3KR12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
J3KR12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
J3KR12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
J3KR12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
J3KR12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
J3KR12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
J3KR12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
J3KR12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
J3KR12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
J3KR12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
J3KR12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
J3KR12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
J3KR12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
J3KR12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
J3KR12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
J3KR12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
J3KR12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
J3KR12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
J3KR12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
J3KR12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
J3KR12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
J3KR12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
J3KR12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
J3KR12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
J3KR12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
J3KR12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
J3KR12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
J3KR12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
J3KR12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
J3KR12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
J3KR12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
J3KR12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
J3KR12 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
J3KR12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
J3KR12 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
J3KR12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
J3KR12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
J3KR12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
J3KR12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
J3KR12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
J3KR12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
J3KR12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
J3KR12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
J3KR12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
J3KR12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
J3KR12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
J3KR12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
J3KR12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
J3KR12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms