Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS3P2A8K0S8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3P2A8K0S8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS3P2A8K0S8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS3P2A8K0S8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms