Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRIQ3A6PVS8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRIQ3A6PVS8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ3A6PVS8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms